В редакторе конфигурации имеется возможность отображать индикатор раскладки в виде флагов.
Нужно поставить галку в

/desktop/mate/peripherals/keyboard/indicator/showFlags.
Для того, чтобы это реализовать, нужно создать каталог flags:

Код:
$ sudo mkdir /usr/share/pixmaps/flags
в который поместите пиктограммы флагов, названных двумя буквами, соответствующих раскладке клавиатуры, например, ru.png или us.png. Пиктограммы флагов можно скачать отсюда. 
Затем нужно дать права пользователю на каталог flags и вложенные в него файлы.
В результате после проделанных действий и перезагрузки компьютера вместо буквенных обозначений на панели отобразится пиктограмма флага.

Увеличивающиеся скриншот

Источник: http://forum.matuntu.info/